劳务派遣员工在上海落户被拒，可能涉及多方面的原因。以下是一些可能的原因归纳：

一、劳务派遣关系问题

1. 劳务合同要求：劳务派遣员工申请落户上海时，需要与公司签订劳务合同。如果未签订劳务合同，或合同存在瑕疵，可能导致落户申请被拒。
2. 派遣单位与用工单位不一致：劳务派遣员工的实际工作单位和为其缴纳社保的单位可能不是同一个单位。这种情况下，如果两个单位之间在落户事宜上存在沟通不畅或责任不清的问题，也可能导致落户申请被拒。

二、社保与个税问题

1. 社保缴纳年限：劳务派遣员工需要在上海连续缴纳社保一定年限（如7年），这是落户的基本条件之一。如果社保缴纳年限不足，将直接导致落户申请被拒。
2. 社保基数与个税匹配：劳务派遣员工的社保基数需要与个税缴纳情况相匹配。如果社保基数低于市场平均水准，或个税申报与实际收入不匹配，将影响落户申请的审核结果。

三、单位资质与经营状况问题

1. 单位资质：办理落户相关事宜的公司需要具备一定的资质和注册资本。如果劳务派遣员工的用工单位或派遣单位不具备这些条件，将影响落户申请的受理和审批。
2. 单位经营状况：单位需要在上海正常经营，且没有被拉入黑名单。如果单位存在经营异常或违法行为，将影响员工的落户申请。

四、个人条件与档案问题

1. 个人条件：劳务派遣员工需要满足一定的个人条件，如年龄、学历、职称等。如果个人条件不符合落户政策的要求，将导致落户申请被拒。
2. 档案问题：来上海前外地最后一份工作没有离职证明，或学习/工作经历与档案记录不符，或档案在自己手里、被拆封、丢失等情况，也可能导致落户申请被拒。

五、其他因素

1. 政策调整：落户政策可能会根据国家和地方的经济社会发展情况进行调整。如果劳务派遣员工在申请落户时遇到政策调整，可能会影响其落户申请的受理和审批。
2. 材料不齐全或不符合要求：如果劳务派遣员工提交的落户申请材料不齐全或不符合要求，也可能导致落户申请被拒。

综上所述，劳务派遣员工在上海落户被拒的原因可能涉及劳务派遣关系、社保与个税、单位资质与经营状况、个人条件与档案以及其他因素等多个方面。因此，在申请落户前，劳务派遣员工需要仔细了解落户政策的要求和条件，并准备好相关的申请材料。同时，也需要与用工单位和派遣单位保持良好的沟通和协作，确保落户申请的顺利进行。